肝胆外科是阜阳市县级重点学科，以肝、胆、胰腺疾病治疗为主和腔镜（微创）手术为特色的专科，设有床位40张。现有主任医师1名、副主任医师2名、主治医师2名。科室拥有德国蛇牌腹腔镜、OLMPUS胆道镜、十二指肠镜等先进的治疗诊断设备。开展的业务技术多项在全市处于领先主导地位。开展肝叶切除术、巨大肝癌切除术、肝脏巨大血管瘤切除术、肝门胆管癌、胆管损伤的修复与重建、肝胆管结石的肝叶切除、复杂胆道疾病、胰腺疾病、胰腺癌、重症胰腺炎的治疗。其中腹腔镜微创手术、十二指肠镜检查与治疗技术、三镜（腹腔镜、胆道镜、ERCP）联合治疗胆道疾病技术，在阜阳市处于领先水平，已开展镜下微创胆囊切除术、胆总管切开取石探查术、肝脏囊肿手术、单孔腹腔镜胆囊切除术、ERCP、EST、ENBD、EPBD、胆总管结石取出、胰管结石取出、胆道支架置入。土室承担市、县科研课题：《ERCP在胆胰系统疾病中的应用》《腹腔镜胆囊切除术2000例的安全性评估》《规则性肝叶切除治疗肝内胆管结石的临床应用》。
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